L’Oratorio di Santa Lucia in passato strutturato nella forma di una chiesa in Perignano vecchio, oggi è inglobata in un casolare ancora esistente a nord di Perignano. La costruzione esistente già in epoca medievale, quando in Perignano esistevano gli abitati di S. Andrea e di S. Lucia, andati poi spopolandosi in seguito alla politica d'abbandono del territorio pisano causata dai Fiorentini. Nel XIX secolo venne costruita l'attuale parrocchiale di Perignano, mentre il vecchio oratorio venne sconsacrato e utilizzato in un altro modo.